Можно ли связать Экстранет и CRM?

Кажется, да.

Тоже сталкивалась с этой проблемой при настройке. Все понятно...
А как-то напрямую нельзя сейчас, да, связать?

На данный момент можно связать клиента из СРМ с экстранетом через ЗАДАЧУ, поставив экстранетчика ответственным по задаче. Поставив в теле задачи перед экстранетчиком или группой экстранета необходимую цель. При этом писать в комментах задачи клиент не сможет.